Construite vers le XIIème siècle, l'église du Palais a appartenu aux chanoines réguliers de Saint-Gérald-lès-Limoges au moins jusqu'en 1186. Par la suite et avant 1217, la paroisse parviendra dans le patrimoine des Templiers et ce jusqu'en 1307 puis passe à l'ordre de Saint-Jean de Jérusalem jusqu'à la Révolution. La commanderie de Limoges dite aussi du Palais réunit alors plusieurs autres commanderies, appelées membres, sous son autorité au sein du grand prieuré et de la langue d'Auvergne. Le presbytère actuel serait un reste du « château » siège du commandeur.
Au XVIème siècle, la nef fut comblée sur une hauteur d’environ un mètre comme le montre notamment une petite niche Renaissance à moitié enfouie dans le sol. En 1711, parmi le mobilier énuméré, figure un Saint-Jean-Baptiste céphalophore. Cette statue est aujourd’hui conservée dans l’église, à l’intérieur d’une cavité fermée par une grille en fer forgé. En 1734, le commandeur de La Valette fait procéder à des réparations de l’église et à la construction de la sacristie. En 1863, le couronnement du pinacle fut complété d’un ajout triangulaire, surmonté d’une croix.
L'église Saint-Jean-Baptiste se compose d’une nef rectangulaire à trois travées, voûtée d’ogives, d'un chœur à chevet plat, éclairé par une baie en plein-cintre et d'un portail occidental surmonté d’un clocher-mur. Un cippe funéraire gallo-romain se situe devant l'entrée de l'église, ainsi qu'une croix reposoir.
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